Desde a década de 90, ao longo de suas participações, o Joinville Esporte Clube nunca obteve sucesso na tão sonhada Copa do Brasil. Nesse ano, o Coelho do Norte do Estado vai para sua 11ª participação na competição e, até agora, sua melhor campanha foi em 2017, quando conseguiu chegar até a quarta fase do campeonato. Nessa temporada, o tricolor tem mais uma chance de fazer a diferença na competição.
Com a vantagem de um empate por jogar fora de casa, o Joinville faz sua estreia na Copa do Brasil de 2021, nesta quarta-feira (17). A equipe do Norte do Estado catarinense enfrenta o Santa Cruz, do Rio Grande do Sul, no estádio dos Plátanos, em Santa Cruz do Sul, a partir das 20h.
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Primeira participação
Após o vice-campeonato catarinense de 1989, o Coelho enfim conseguiu o acesso para sua primeira participação na Copa do Brasil do ano de 1990. O Tricolor só não esperava encarar um gigante logo na estreia da competição. O Grêmio, equipe campeã da edição anterior, foi o responsável por eliminar a equipe catarinense em sua primeira participação. No jogo de ida, em seu antigo estádio, Ernestão, o Joinville até encarou a equipe gaúcha de forma igual, onde empatou por 1 a 1. Já na partida de volta, o Coelho foi presa fácil e foi derrotado por 3 a 1, em Porto Alegre.
Chegada mais longe
Em sua chegada mais longe na competição, no ano de 2017, o Joinville foi eliminado na 4ª fase pela equipe do Sport de Recife. No jogo de ida, fora de casa, a equipe catarinense foi vencida pelo placar de 2 a 1. Já no segundo confronto, no tempo normal, o Coelho venceu a equipe pernambucana pelo mesmo placar e levou o jogo para os pênaltis, mas a estrela do goleiro do Leão da Ilha brilhou mais forte. Com duas defesas, Magrão levou o Sport às oitavas de final da Copa do Brasil, fazendo com que a equipe catarinense desse adeus à competição.
Joinville x Sport na Copa do Brasil de 2017 – Foto: Beto Lima 
Joinville e Atlético-CE na Copa do Brasil de 2019 – Foto: JEC, Divulgação
Última participação
Em sua última participação na competição, no ano de 2019, a equipe catarinense foi eliminada na 1ª fase, no duelo contra o Atlético-CE, pelo placar de 2 a 0, fora de casa. Naquela época, o clube cearense ocupava a 176º colocação no ranking da CBF.
Confira as participações do JEC na Copa do Brasil
| Ano | Fase máxima | Adversário |
| 1990 | 1ª | Grêmio |
| 2001 | 1ª | Corinthians |
| 2002 | 1ª | Americano-RJ |
| 2013 | 2ª | Santos |
| 2014 | 1ª | Novo Hamburgo-RS |
| 2015 | 1ª | Ituano-SP |
| 2016 | 2ª | Ceará |
| 2017 | 4ª | Sport |
| 2018 | 2ª | Vila Nova-GO |
| 2019 | 1ª | Atlético-CE |